外表看似小孩，其真實身份是被稱作“日本警察的救世主”的高中生偵探——工藤新一。和青梅竹馬的毛利蘭在游樂園約會時，目擊到黑衣組織的交易現(xiàn)場，被灌下開發(fā)中的毒藥——APTX4869，身體縮小了。從此以后化名江戶川柯南，寄住在父親以偵探為業(yè)的小蘭家，過著日復一日解決案件的日子。

江戶川柯南原本的樣子。被稱為“日本警察的救世主”，以高中生偵探身份活動。父親是世界級推理小說家工藤優(yōu)作，母親是前人氣女演員藤峰有希子，他是這對名人父母的兒子。崇拜夏洛克·福爾摩斯，擅長足球。自從被灌下APTX4869，就斷了消息，過上了柯南的生活。

工藤新一的青梅竹馬。空手道部主將，擁有都大會第一名實力的文武雙全的女高中生。一邊等待突然消失的新一的歸來，一邊溫柔地看護著寄住的柯南以及少年偵探團。 本作中，父親小五郎被當作爆炸恐襲的犯人而被逮捕，因而激烈地動搖。向身為律師的分居中的母親妃英理求助。

小蘭的父親，與妻子妃英理分居中。經(jīng)營著偵探事務所，以前是警視廳搜查一科的刑警，與目暮警部是故交。多虧柯南的名推理而作為“沉睡的小五郎”一躍成名。 本作中，突然被當作爆炸恐襲的犯人，備受責難。

成為了毛利小五郎弟子的私家偵探，在事務所樓下的波洛咖啡廳打工。其真實身份，是黑衣組織的成員“波本”、隸屬于警察廳警備局警備企劃科（俗稱：公安警察）的“降谷零”。

強行犯三系的警部。責任感強，在現(xiàn)場常以人命優(yōu)先。也深得部下信賴。曾是小五郎刑警時代的上司。

住在工藤新一家隔壁的發(fā)明家。知道柯南的真實身份，用各種各樣的發(fā)明來支援他。保護相同狀況的灰原哀，對少年偵探團也照料得很好。本作中制作出了特制的無人機，讓少年偵探團玩耍。

少年偵探團的偶像存在。自稱“可愛的女偵探”，好奇心旺盛，但也是個愛哭鬼。另外，很喜歡柯南，她在灰原轉(zhuǎn)學之初，也曾含有醋意地問“你喜歡柯南嗎”，但現(xiàn)在是少年偵探團女成員，進行著團隊合作。

自稱少年偵探團團長。經(jīng)常說錯話，有無人匹敵的強大正義感。有很大食量的吃貨，最喜歡鰻魚飯。

認真的頭腦派，有時也會解救柯南的危機……有協(xié)作性，是個紳士，有時也會守護步美和灰原。